云南省医疗保障局，根据《中共中央办公厅、国务院办公厅关于印发〈云南省机构改革方案〉的通知》、《中共云南省委贯彻〈中共中央关于深化党和国家机构改革的决定〉的实施意见》精神，云南省医疗保障局是云南省人民政府直属机构，为副厅级。
2018年11月26日，云南省医疗保障局正式挂牌成立。副省长李玛琳出席挂牌仪式并致辞。
现任云南省医疗保障局局长：黄宏伟
