新疆维吾尔自治区畜牧兽医局，根据中共中央、国务院批准的《新疆维吾尔自治区机构改革方案》（厅字〔2018〕110号）和自治区党委办公厅、自治区人民政府办公厅印发的《关于〈新疆维吾尔自治区机构改革方案〉的实施意见》（新党办发〔2018〕52号），自治区畜牧兽医局是农业农村厅的部门管理机构，为副厅级。
现任新疆维吾尔自治区畜牧兽医局党组书记（厅长级）：卢蜀江
