上海市虹口区人民政府是上海市虹口区人民代表大会的执行机关,是上海市虹口区的一级国家行政机关;对虹口区人民代表大会和上海市人民政府负责;在虹口区人民代表大会闭幕期间,对虹口区人民代表大会常务委员会负责并报告工作。
上海市虹口区人民政府分别由区长、副区长和局长、委员会主任等组成。每届任期五年,实行区长负责制。