三江源国家公园自然资源所有权由中央人民政府直接行使,试点期间委托青海省人民政府代行。省级层面,在青海省西宁市挂牌成立三江源国家公园管理局,为青海省人民政府派出机构,承担三江源国家公园试点区以及青海省三江源国家级自然保护区范围内各类国有自然资源资产所有者管理职责。